Andrew E. Teschendorff

Andrew E. Teschendorff, PhD

教授

上海营养与健康研究所

上海生物科学研究所

计算生物学重点实验室

中国科学院，中国

关于演讲人：

2020年-至   今：中国科学院上海营养与健康研究所/中国科学院计算生物学重点实验室研究组长，研究员

2015年-至   今：英国伦敦学大学学院（University College London）癌症研究所荣誉研究员

2013年-2019年：中国科学院-马普学会计算生物学伙伴研究所（中国科学院上海生命科学研究院计算生物学研究所）研究组长，计算系统表观基因组学研究员

2015年-2019年：英国皇家学会Newton Advanced Fellow

2008年-2013年：英国伦敦大学学院（University College London）癌症研究所

2003年-2008年：英国剑桥大学肿瘤系乳腺癌功能基因组学实验室（Carlos Caldas教授领衔），Senior Postdoctoral Fellow

2001年-2003年：University of Warwick数学研究所数学生物学研究组（David A. Rand教授领衔），Research assistant

2000年-2001年：British Telecom Labs复杂性研究组（Sverrir Olafsson博士领衔），Research staff scientist

1996年-2000年：英国剑桥大学，获理论粒子物理博士学位

1995年-1996年：英国剑桥大学，Certificate of Advanced Study，数学专业，Awarded Distinction

1990年-1995年：英国爱丁堡大学，学士学位，数理物理学专业，Awarded 1st Class

研究方向：

计算系统表观基因组学

研究内容：

主要是统计生物信息学，主要关注癌症表观基因组学和癌症系统生物学的统计学分析。研究的目的是应用创新的计算学方法帮助理解肿瘤形成并开发新的一般癌症风险预测和早期诊断工具。

近年发表文章：

1. Garmire LX, Li Y, Huang Q, Xu C, Teichmann SA, Kaminski N, Pellegrini M, Nguyen Q, Teschendorff AE (2024) Challenges and perspectives in computational deconvolution of genomics data. Nat Methods 21:391-400.

2. Maity AK, Teschendorff AE (2023) Cell-attribute aware community detection improves differential abundance testing from single-cell RNA-Seq data. Nat Commun 14:3244.

3. Zhu T, Liu J, Beck S, Pan S, Capper D, Lechner M, Thirlwell C, Breeze CE, Teschendorff AE (2022) A pan-tissue DNA methylation atlas enables in-silico decomposition of human tissue methylomes at cell-type resolution. Nat Methods 19:296-306.

4. CNCB-NGDC Members and Partners (2022) Database Resources of the National Genomics Data Center, China National Center for Bioinformation in 2022. Nucleic Acids Res 50(D1).

5. Teschendorff AE, Feinberg AP (2021) Statistical mechanics meets single-cell biology. Nat Rev Genet 22:459-476.